新華社天津9月17日電(張建新、趙習鈞)天津大學合成生物學元英進教授團隊首次將自主設計合成的5號釀酒酵母環(huán)形染色體進行基因組重排,為探索環(huán)形染色體結構變異和功能提供了新的研究思路和模型。17日,在最新一期上線的國際學術期刊《自然·通訊》上刊載了這一名為《環(huán)形5號染色體基因組重排》的論文。
染色體結構變異對生物性狀多樣性具有重要影響。常見的真核生物染色體一般都是成線性的棒狀結構,而人類的某些染色體發(fā)生變異后會出現(xiàn)“成環(huán)”的現(xiàn)象。染色體的環(huán)化與癌癥、癲癇、智力發(fā)育遲緩、白血病等多種疾病的發(fā)生密切相關。目前對環(huán)形染色體結構變異及所產(chǎn)生表型的認知相對匱乏。
元英進教授團隊以此前人工合成的釀酒酵母環(huán)形5號染色體為研究對象,利用SCRaMbLE基因組重排系統(tǒng)對其進行基因組重排,發(fā)現(xiàn)環(huán)形染色體不同于線性染色體的多種結構性變化。
研究人員選擇了抗癌活性化合物——紫色桿菌素前體物作為目標性狀,通過多輪基因組重排來探究染色體結構變異對細胞功能的影響。研究發(fā)現(xiàn),環(huán)形染色體基因組重排過程中會連續(xù)產(chǎn)生復雜的基因組結構變異和表型優(yōu)化。環(huán)形染色體重排后,發(fā)現(xiàn)了1、3、6、12、13和環(huán)形5號染色體的數(shù)目加倍,形成染色體非整倍體酵母菌株。重排使染色體自身產(chǎn)生更多的非對稱性結構變異,包括DNA片段的重復和片段插入;經(jīng)過5次連續(xù)誘導重排后,所獲得環(huán)形染色體的長度比原始染色體增加了一倍以上。
環(huán)形染色體重排過程檢測到更多的非天然新型結構變異。同時發(fā)現(xiàn),未表征基因YER182W的缺失與PDV的產(chǎn)量提升具有相關性。
研究表明,環(huán)形染色體在基因組重排過程中通過修改染色體數(shù)目和結構可以持續(xù)產(chǎn)生染色體結構變異和細胞表型增強,進而推動基因組的進化,為理解DNA基因型與生物表型關系提供了有效的研究模型。
該研究獲得了國家自然科學基金和國家重點基礎研究發(fā)展計劃等基金的大力支持。
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