新華社北京2月1日電(記者魏夢佳)北京大學(xué)與清華大學(xué)聯(lián)合課題組近期在國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《美國科學(xué)院院刊》發(fā)表論文,稱開發(fā)出了名為“SHERRY”的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫新方法。研究團(tuán)隊表示,這種方法大大簡化了建庫過程,不僅可用于高質(zhì)量的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,對包括新型冠狀病毒等樣本的測序質(zhì)量和速度也有望顯著提升。
核糖核酸(RNA)是存在于生物細(xì)胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。目前,RNA測序技術(shù)已廣泛應(yīng)用于繪制物種轉(zhuǎn)錄組圖譜、研究疾病分子調(diào)控機(jī)制等方向。據(jù)了解,針對不同研究需求,不同起始量的RNA需采用不同的RNA擴(kuò)增方法,但目前常見的擴(kuò)增方法大多操作繁復(fù)、耗時長。對于微量樣本的檢測,也存在很多技術(shù)挑戰(zhàn)。
研究人員發(fā)現(xiàn),被廣泛應(yīng)用于DNA測序建庫技術(shù)的Tn5轉(zhuǎn)座酶可以直接作用于RNA/DNA雜交鏈,從而省去傳統(tǒng)RNA建庫技術(shù)中的擴(kuò)增等必不可少但繁瑣的操作步驟,同時也避免了預(yù)擴(kuò)增過程中所帶來的偏向性。這種新的基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫方法,被命名為“SHERRY”。
據(jù)作為課題組成員的北京大學(xué)黃巖誼教授和清華大學(xué)王建斌研究員介紹,實驗結(jié)果表明,SHERRY建庫質(zhì)量較好,對堿基序列表現(xiàn)出了較高的均衡率,且操作流程簡單,整個流程僅需要5個步驟,可在一個試管中完成,時間僅約4小時,其中手工操作時間不到半小時,大大節(jié)省了實驗成本。
課題組專家、北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心主任謝曉亮教授表示,新方法應(yīng)用廣泛,首個臨床應(yīng)用是對新型冠狀病毒感染者的樣本進(jìn)行測序。與現(xiàn)有的RNA測序建庫方法相比,“SHERRY”更靈敏、更簡單,這對檢測和分析十分重要。
“我們的團(tuán)隊目前正在夜以繼日、爭分奪秒地攻關(guān),希望提供更好的新型冠狀病毒的測序方法,服務(wù)疫情防控需要?!敝x曉亮說。
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